Protein–RNA interactions for Protein: A0A1Y7VIZ1

Platr25, Pluripotency-associated transcript 25, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Platr25A0A1Y7VIZ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms