Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms