Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trbv26A0A0B4J1P5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trbv26A0A0B4J1P5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trbv26A0A0B4J1P5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trbv26A0A0B4J1P5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trbv26A0A0B4J1P5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trbv26A0A0B4J1P5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trbv26A0A0B4J1P5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trbv26A0A0B4J1P5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Trbv26A0A0B4J1P5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Trbv26A0A0B4J1P5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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