Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm13536-201ENSMUST00000132913 766 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm16585-201ENSMUST00000161442 610 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Ceacam1-204ENSMUST00000205308 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm4178-201ENSMUST00000218307 649 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm18362-201ENSMUST00000221786 529 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm23840-201ENSMUST00000116950 97 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Olfr400-ps1-201ENSMUST00000118094 955 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm25190-201ENSMUST00000176664 95 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm35501-202ENSMUST00000215101 459 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm6989-201ENSMUST00000218409 654 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hmg20aQ9DC33 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms