Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprtQ99M80 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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PtprtQ99M80 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Olfr1219-202ENSMUST00000213724 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Serpina3f-203ENSMUST00000167049 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms