Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms