Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Akap14-201ENSMUST00000046557 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Sox2ot-210ENSMUST00000197697 2533 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Itgb6-201ENSMUST00000028348 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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