Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms