Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms