Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cux1P53564 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cux1P53564 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cux1P53564 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cux1P53564 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cux1P53564 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cux1P53564 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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