Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprkP35822 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms