Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm44018-201ENSMUST00000204471 407 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm45834-201ENSMUST00000212445 454 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm34611-201ENSMUST00000223252 627 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC110236.1-201ENSMUST00000227807 527 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Fam136b-ps-201ENSMUST00000068987 412 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm16026-201ENSMUST00000094774 580 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ints14-202ENSMUST00000170517 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Cyp2d12-201ENSMUST00000068861 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm7203-201ENSMUST00000210880 1404 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Cfl2-201ENSMUST00000078124 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Snhg14-206ENSMUST00000187666 2517 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Trappc12-202ENSMUST00000168129 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm44802-201ENSMUST00000208026 1916 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm18637-201ENSMUST00000217665 1900 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Stat1-212ENSMUST00000191435 2803 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Dennd2d-204ENSMUST00000183271 2050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Naalad2-204ENSMUST00000166825 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Parva-203ENSMUST00000106643 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm45280-201ENSMUST00000210484 2552 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 4933402N03Rik-201ENSMUST00000070980 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Smpd4-209ENSMUST00000165363 3046 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Pign-210ENSMUST00000190811 3015 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Tshz2-201ENSMUST00000109157 5083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm9159-201ENSMUST00000120661 566 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm13415-202ENSMUST00000135829 565 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Dcpp2-202ENSMUST00000168272 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Hoxd9P28357 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Hoxd9P28357 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Hoxd9P28357 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm32089-201ENSMUST00000221222 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC133183.2-201ENSMUST00000221543 280 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm5789-201ENSMUST00000222643 865 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 1700009N14Rik-201ENSMUST00000029955 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Tarm1-201ENSMUST00000065703 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Snora74a-201ENSMUST00000083715 196 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm26520-201ENSMUST00000180719 1423 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Cdh26-202ENSMUST00000108912 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Klrb1b-201ENSMUST00000032472 2228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr554-203ENSMUST00000215995 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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