Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm25193-201ENSMUST00000176615 97 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm8682-201ENSMUST00000121310 498 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 F730035M05Rik-201ENSMUST00000145871 1296 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Rnf141-210ENSMUST00000177462 859 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Rps6-ps2-201ENSMUST00000079841 747 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Olfr1418-201ENSMUST00000079875 1072 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 n-R5s74-201ENSMUST00000082654 116 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VimP20152 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm23659-201ENSMUST00000102245 110 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VimP20152 Gm14487-201ENSMUST00000145413 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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