Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Zwilch-201ENSMUST00000122091 2957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sptan1P16546 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms