Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 4930455G09Rik-201ENSMUST00000126231 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm14061-201ENSMUST00000155923 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Rasgrf1-201ENSMUST00000034909 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TtrP07309 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm13536-201ENSMUST00000132913 766 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm17828-201ENSMUST00000183380 799 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm44725-201ENSMUST00000205307 391 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms