Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rrn3B2RS91 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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