Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc12Q8K2L8 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms