Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Ercc8Q8CFD5 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Ercc8Q8CFD5 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Ercc8Q8CFD5 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Ercc8Q8CFD5 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Ercc8Q8CFD5 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Ercc8Q8CFD5 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Ercc8Q8CFD5 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Ercc8Q8CFD5 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Ercc8Q8CFD5 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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Ercc8Q8CFD5 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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Ercc8Q8CFD5 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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Ercc8Q8CFD5 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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Ercc8Q8CFD5 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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