Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChfrQ810L3 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms