Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms