Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms