Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tubgcp3P58854 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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