Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm12038-201ENSMUST00000117322 207 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm12206-201ENSMUST00000119795 601 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm7577-201ENSMUST00000182543 982 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 AC025913.1-202ENSMUST00000220385 824 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm18114-201ENSMUST00000221780 523 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Rasgrp1-203ENSMUST00000172901 1903 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P58686 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm26705-201ENSMUST00000180761 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm13402-201ENSMUST00000153600 424 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 1110059E24Rik-202ENSMUST00000177577 599 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Tmem265-202ENSMUST00000190278 587 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm6072-201ENSMUST00000203989 496 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm44714-201ENSMUST00000208665 657 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm40578-202ENSMUST00000221429 920 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P58686 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms