Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC101831.1-201ENSMUST00000228245 691 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Rab3b-201ENSMUST00000003502 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Myl1-202ENSMUST00000119429 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Med6-204ENSMUST00000161211 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 241.8 ms