Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-67-201ENSMUST00000103538 294 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 CT033781.3-201ENSMUST00000221886 504 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms