Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms