Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Rmi1-205ENSMUST00000225828 3594 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm37409-201ENSMUST00000195811 1626 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 H2-M10.5-201ENSMUST00000041531 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Trim21-201ENSMUST00000033264 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gsk3b-202ENSMUST00000114750 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm23659-201ENSMUST00000102245 110 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Phyhd1-203ENSMUST00000113643 1195 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm40-201ENSMUST00000122131 660 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm12949-201ENSMUST00000143382 362 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm23195-201ENSMUST00000158814 129 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Phf11d-202ENSMUST00000160425 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 1700019D03Rik-204ENSMUST00000186266 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm38358-201ENSMUST00000195144 428 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gabra4-203ENSMUST00000198138 440 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm43145-201ENSMUST00000198963 628 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm44714-201ENSMUST00000208665 657 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Olfr1512-201ENSMUST00000071221 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 9430073C21Rik-201ENSMUST00000145346 2173 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Rab36-206ENSMUST00000146440 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Dnajc28-204ENSMUST00000169982 3535 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Homer1-201ENSMUST00000060490 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm11239-201ENSMUST00000171348 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm11237-201ENSMUST00000178319 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm11236-201ENSMUST00000180092 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm428-201ENSMUST00000084475 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm11238-201ENSMUST00000084479 1323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm11487-201ENSMUST00000084480 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Hdhd2-207ENSMUST00000147332 1705 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Rasgrp1-205ENSMUST00000173541 2283 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm13108-201ENSMUST00000122287 1455 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Zscan22-202ENSMUST00000117189 2995 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Ripor2-203ENSMUST00000091694 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Wdr5b-201ENSMUST00000042203 1784 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Pign-210ENSMUST00000190811 3015 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf10b-201ENSMUST00000022663 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Olfr155-202ENSMUST00000107860 3480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim39Q9ESN2 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms