Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms