Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf17Q99MV7 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf17Q99MV7 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf17Q99MV7 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf17Q99MV7 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf17Q99MV7 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf17Q99MV7 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf17Q99MV7 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf17Q99MV7 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf17Q99MV7 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf17Q99MV7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Slc5a6-205ENSMUST00000202520 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf17Q99MV7 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms