Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm26749-201ENSMUST00000181387 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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