Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms