Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Celf2-223ENSMUST00000182851 3587 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm26749-201ENSMUST00000181387 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Cyp17a1-201ENSMUST00000026012 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms