Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprkP35822 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Plcd4-202ENSMUST00000067916 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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