Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 AC153500.1-201ENSMUST00000219794 625 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms