Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC166358.1-201ENSMUST00000220677 105 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC153662.2-201ENSMUST00000221097 120 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC156037.2-201ENSMUST00000221284 112 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC166341.6-201ENSMUST00000221528 105 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 CT030242.1-201ENSMUST00000221945 125 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC124772.2-201ENSMUST00000222049 154 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC153663.1-201ENSMUST00000222165 120 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 CT030157.1-201ENSMUST00000222355 148 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC150661.2-201ENSMUST00000222418 105 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC127242.2-201ENSMUST00000223138 148 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Rps6-ps2-201ENSMUST00000079841 747 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 4136 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Ldb2-201ENSMUST00000070748 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Cdh26-202ENSMUST00000108912 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r12a-201ENSMUST00000070663 3403 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 F730016J06Rik-202ENSMUST00000128888 3699 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm21129-201ENSMUST00000185932 2560 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm29258-201ENSMUST00000186842 2564 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Immt-201ENSMUST00000064062 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Lif-202ENSMUST00000066283 4026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hdac5Q9Z2V6 Scnn1a-203ENSMUST00000176110 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Supt20-211ENSMUST00000200441 2154 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gatad2b-201ENSMUST00000049382 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Cd4-201ENSMUST00000024044 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 2610008E11Rik-201ENSMUST00000039271 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm8767-201ENSMUST00000215786 1070 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Palb2-203ENSMUST00000106468 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Tmem69-202ENSMUST00000106478 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Uroc1-202ENSMUST00000164761 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm38110-201ENSMUST00000194594 1551 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Chrdl2-202ENSMUST00000107084 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Ppwd1-201ENSMUST00000022226 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Tdrd1-204ENSMUST00000121249 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Ublcp1-201ENSMUST00000102795 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Zp2-201ENSMUST00000033207 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm42788-201ENSMUST00000201604 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms