Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms