Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rb1cc1Q9ESK9 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rb1cc1Q9ESK9 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rb1cc1Q9ESK9 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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