Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
OtofQ9ESF1 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms