Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm20072-201ENSMUST00000202231 292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 AC133183.2-201ENSMUST00000221543 280 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 AC165254.1-203ENSMUST00000222925 574 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 AC192333.4-201ENSMUST00000224269 981 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Smpd4-209ENSMUST00000165363 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Ldb2-207ENSMUST00000199534 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Cdh26-202ENSMUST00000108912 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Eya3-202ENSMUST00000079157 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Ttc21a-201ENSMUST00000035100 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Zfp248-201ENSMUST00000069292 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Cass4-202ENSMUST00000103073 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Dlg2-202ENSMUST00000098308 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Napg-201ENSMUST00000025474 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Hibch-202ENSMUST00000159352 1704 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Pcdhb15-201ENSMUST00000050034 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm9729-201ENSMUST00000196364 265 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm5981-201ENSMUST00000199912 487 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm43806-201ENSMUST00000201766 469 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Zfp961-201ENSMUST00000109997 2713 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 Tmcc1-209ENSMUST00000173548 1622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Clcn1Q64347 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms