Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Slc5a6-205ENSMUST00000202520 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm43890-201ENSMUST00000203437 2799 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms