Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms