Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm43792-201ENSMUST00000202492 2210 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Irx1P81068 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms