Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RxraP28700 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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RxraP28700 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RxraP28700 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxraP28700 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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