Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm43942-201ENSMUST00000204522 2859 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Zfp82-203ENSMUST00000182546 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm12408-206ENSMUST00000211577 1983 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 CT030170.4-201ENSMUST00000221539 1538 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Cenpq-201ENSMUST00000087114 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Slco2b1-203ENSMUST00000107088 4369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Pkd2l2-201ENSMUST00000014647 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm12430-201ENSMUST00000121539 1322 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm25232-201ENSMUST00000104502 132 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Bdnf-206ENSMUST00000111046 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm11440-201ENSMUST00000121509 527 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm11534-202ENSMUST00000129261 470 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps87-201ENSMUST00000174393 876 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Hcfc1r1-202ENSMUST00000179928 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 1700100L14Rik-202ENSMUST00000189028 762 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37282-201ENSMUST00000191987 164 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37665-201ENSMUST00000192353 149 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm43835-201ENSMUST00000195932 149 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm43535-201ENSMUST00000197846 164 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm44379-201ENSMUST00000204501 164 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm44268-201ENSMUST00000204814 164 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm10043-201ENSMUST00000210691 235 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 CT030709.1-201ENSMUST00000214443 443 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm11149-202ENSMUST00000215070 1169 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm4178-201ENSMUST00000218307 649 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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Hoxd9P28357 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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Hoxd9P28357 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Hoxd9P28357 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Hoxd9P28357 Zmynd8-201ENSMUST00000018050 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Hoxd9P28357 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm3147-202ENSMUST00000201071 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 A430089I19Rik-201ENSMUST00000097479 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Prg4-202ENSMUST00000111901 3495 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Slc44a1-202ENSMUST00000107645 2365 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Phactr1-205ENSMUST00000128646 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Supt20-202ENSMUST00000170552 1968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Oog4-201ENSMUST00000061277 1981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37536-201ENSMUST00000194710 2491 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr324-202ENSMUST00000214990 3624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Heatr9-201ENSMUST00000019069 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ube2v1-201ENSMUST00000060645 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms