Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmf1B9EKI3 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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