Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm24542-201ENSMUST00000103870 110 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm13254-201ENSMUST00000118295 654 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm6136-201ENSMUST00000120149 891 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm13161-201ENSMUST00000120609 559 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Mettl8-205ENSMUST00000121586 1151 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Fam229b-206ENSMUST00000136546 592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm25767-201ENSMUST00000158572 124 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm23823-201ENSMUST00000158740 124 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm17158-201ENSMUST00000168150 493 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm3571-201ENSMUST00000170703 1060 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Mir7659-201ENSMUST00000184079 58 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Btg1-ps1-202ENSMUST00000184432 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm21013-201ENSMUST00000184952 1201 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 1700095A13Rik-201ENSMUST00000185460 711 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 4933417G07Rik-201ENSMUST00000199681 1137 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Apoc1-204ENSMUST00000207978 339 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 AC167202.2-201ENSMUST00000220155 296 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 4930553J12Rik-201ENSMUST00000023648 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Rasgrf1-201ENSMUST00000034909 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Smurf1Q9CUN6 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm7027-201ENSMUST00000086958 862 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm43409-201ENSMUST00000195921 2162 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Smurf1Q9CUN6 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 Tpbpa-201ENSMUST00000021885 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 1700010N08Rik-202ENSMUST00000188166 1323 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smurf1Q9CUN6 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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