Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ercc8Q8CFD5 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ercc8Q8CFD5 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ercc8Q8CFD5 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ercc8Q8CFD5 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ercc8Q8CFD5 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ercc8Q8CFD5 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ercc8Q8CFD5 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ercc8Q8CFD5 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ercc8Q8CFD5 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ercc8Q8CFD5 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Ercc8Q8CFD5 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Ercc8Q8CFD5 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ercc8Q8CFD5 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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