Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Pou1f1-203ENSMUST00000176038 1174 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm29961-202ENSMUST00000215431 637 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Prpmp5-201ENSMUST00000048686 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mark1-201ENSMUST00000027929 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Krba1-208ENSMUST00000203371 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Pitrm1-207ENSMUST00000222485 3906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Scml2-202ENSMUST00000074802 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Tnxa-201ENSMUST00000173277 2975 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Trim35Q8C006 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Arhgdib-203ENSMUST00000111892 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Trim35Q8C006 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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