Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Slc34a1-205ENSMUST00000225259 3983 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms