Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Rpsa-ps3-201ENSMUST00000117789 876 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13833-201ENSMUST00000146766 719 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm3571-201ENSMUST00000170703 1060 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm24325-201ENSMUST00000175344 74 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC154028.1-201ENSMUST00000217071 379 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm4178-201ENSMUST00000218307 649 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC116596.2-201ENSMUST00000226642 526 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gstm5-201ENSMUST00000004134 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Tpbpa-201ENSMUST00000021885 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Fhad1os1-201ENSMUST00000146094 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AF067061-202ENSMUST00000181748 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5a-212ENSMUST00000198451 1032 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm12691-202ENSMUST00000222516 918 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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